CUT&Tag vs ChIP-Seq

Von der Datenerzeugung bis zur Analyse

Präsentiert von Active Motif

Sprecher: Dr. Sarantis Chlamydas, Ph.D., Senior Market Development Manager bei Active Motif, und Amit Sinha, Ph.D., CEO bei Basepair

Inhalt

In diesem Webinar erörtern Dr. Sarantis Chlamydas, Ph.D., Senior Market Development Manager bei Active Motif, und Amit Sinha, Ph.D., CEO von Basepair Tech, die besten Möglichkeiten zur Generierung hochwertiger Daten mit fortschrittlichen Epigenomik-Techniken, einschließlich CUT&Tag und ChIP-Seq, und zur anschließenden effizienten Verarbeitung und Interpretation epigenomischer Daten mit Hilfe optimierter Analysepipelines.

 

Generierung und Analyse von Epigenomikdaten

Sarantis Chlamydas, Ph.D. - Active Motif, Inc.

Dank moderner Hochdurchsatztechniken wie ChIP-Seq, CUT&Tag, ATAC-Seq und RNA-Seq wird das Potenzial der personalisierten Medizin immer besser erschlossen.

In diesem Webinar werden wir:

• einen Überblick über die neuartigen Tools, epigenetischen Reagenzien und End-to-End-Dienstleistungen von Active Motif geben
• eine Reihe von Daten besprechen, die unsere Wissenschaftler für die Arzneimittelforschung und die Erforschung menschlicher Krankheiten generiert haben
• Tipps und Tricks, wie wir die Generierung und Analyse von "Epigenomics"-Daten für die klinische Diagnose und Behandlung unterstützen

 

Aufschlüsselung der Bioinformatik - CUT&Tag vs. ChIP-seq

Amit Sinha, Ph.D. - Basepair Tech

CUT&Tag entwickelt sich zur bevorzugten Technologie für die epigenomische Profilerstellung. Das Versprechen eines größeren Signals aus weniger Zellen mit einem hohen Durchsatz ist unwiderstehlich. Aus der Vogelperspektive sehen die Schritte der Datenanalyse und die verwendeten Tools zwischen CUT&Tag und ChIP-Seq sehr ähnlich aus. Bei näherer Betrachtung werden jedoch die Unterschiede in der Analyse deutlich, insbesondere in Bezug auf die verwendeten Parameter.

In unserer Diskussion werden wir Folgendes behandeln:

• Die Schritte der Datenverarbeitung - Gemeinsamkeiten und Unterschiede
• Die beiden wichtigsten verfügbaren Peak-Calling-Tools - MACS und SEACR
• Interpretation der Werte und Ergebnisse der einzelnen Analyseschritte